नाग पंचमी के पावन अवसर पर भक्तगण भगवान के रूप में नागों या साँपों की पूजा करते हैं। लोग मिट्टी से साँप बनाकर उन्हें विभिन्न आकार देते हैं, रंगते हैं और फिर उनकी पूजा करते हैं, दूध तथा अन्य खाद्य पदार्थ चढ़ाते हैं। यह विशेष दिन इन पूजनीय प्राणियों के सम्मान के लिए समर्पित है, जिनके बारे में माना जाता है कि वे सुरक्षा प्रदान करते हैं और समृद्धि लाते हैं।
नाग पंचमी के दिन ज़मीन जोतने से बचना चाहिए, क्योंकि इससे नीचे रहने वाले साँपों को चोट लग सकती है या उन्हें नुकसान भी पहुँच सकता है। इसी प्रकार, नाग पंचमी के दौरान पेड़ों को काटने से भी बचना चाहिए। इस दिन साँपों को किसी भी प्रकार से नुकसान या चोट नहीं पहुँचानी चाहिए।
गरुड़ पुराण में बताया गया है कि जो भक्त नाग पंचमी पर साँपों की पूजा करते हैं और उसके बाद ब्राह्मणों को भोजन कराते हैं, उन्हें अनेक लाभ मिलते हैं और वे खुशहाल जीवन जीते हैं। ऐसा माना जाता है कि साँपों की पूजा करने से भक्त को साँप के काटने के डर से सुरक्षा मिलती है। नाग पंचमी का उत्सव भगवान कृष्ण द्वारा कालिया नाग पर मिली विजय का भी जश्न मनाता है। जब भगवान कृष्ण ने कालिया नाग को पराजित किया और नाग तथा उसकी पत्नियों को यह एहसास हुआ कि कृष्ण कोई साधारण बालक नहीं हैं, तो उन्होंने कालिया नाग के प्राणों की भीख माँगी। कृष्ण ने कालिया नाग से वादा लिया कि वह अब गोकुल के निवासियों को परेशान नहीं करेगा, जिसके बाद उन्होंने उसका जीवन बख्श दिया।